美國俄亥俄州哥倫布(COLUMBUS, Ohio)消息，科學(xué)家通過對(duì)突變檢測方法的比較研究發(fā)現(xiàn)，人們以前可能低估了存在于乳腺與卵巢腫瘤易感患者身上的關(guān)鍵基因突變數(shù)量。這個(gè)突變研究新發(fā)現(xiàn)對(duì)臨床腫瘤遺傳學(xué)家和他們的患者都具有深遠(yuǎn)的意義。

這項(xiàng)研究發(fā)表于2001年12月11日的醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志(Journal of Medical Genetics)上。他們用四種不同的方法去比較兩類與乳腺和卵巢腫瘤發(fā)生強(qiáng)相關(guān)性的長片段基因：BRCA1和BRCA2，來確定哪一種方法能夠zui有效的發(fā)現(xiàn)存在于基因上的突變。他們希望發(fā)現(xiàn)用以上四種突變檢測技術(shù)，能夠?yàn)檫z傳流行病學(xué)建立一個(gè)客觀的檢測依據(jù)。

科學(xué)家以前的研究顯示在BRCA1和BRCA2兩個(gè)基因都存在突變的婦女中，有56-87 %的人會(huì)患乳腺癌，有27-44%的人會(huì)患卵巢癌。而流行病學(xué)的研究則顯示，只有不到5%的乳腺癌患者會(huì)帶有這兩種突變。

zui近一項(xiàng)由俄亥俄州立大學(xué)臨床癌癥遺傳學(xué)計(jì)劃主席Charis Eng博士和猶他州鹽湖城Myriad遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室Tom S. Frank博士領(lǐng)導(dǎo)的研究顯示，后者的數(shù)據(jù)明顯偏低，這可能是由于遺傳突變篩選的方法造成的。

Eng說，對(duì)突變zui直接的遺傳學(xué)檢測就是對(duì)DNA片段進(jìn)行直接測序，但這種方法過于昂貴，而且極為耗費(fèi)勞動(dòng)力。因此很多實(shí)驗(yàn)室在進(jìn)行BRCA1 和BRCA2基因的流行病學(xué)研究時(shí)，都選擇了一些快捷而便宜的篩選方法。

在乳腺癌信息中心(Breast Cancer Information Core)的贊助下，他們就目前的一些篩選方法與基因測序方法進(jìn)行了比較。收集了65份樣品，其中58個(gè)含有BRCA1的突變。然后將這些樣品送往四個(gè)試驗(yàn)室，分別采用不同的篩選方法對(duì)樣品進(jìn)行檢測。這四個(gè)實(shí)驗(yàn)室是：美國德克薩斯大學(xué)醫(yī)療研究中心(University of Texas Health Science Center) Jan Vijg 博士的實(shí)驗(yàn)室，西雅圖Fred Hutchinson 癌癥研究中心Elaine Ostrander 博士的實(shí)驗(yàn)室，荷蘭雷登大學(xué)(the University of Leiden)的實(shí)驗(yàn)室和奧地利維也納大學(xué)Teresa Wagner博士的實(shí)驗(yàn)室。 他們各自采用的方法分別是：SSCP (DNA單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析)、CSGE (構(gòu)象敏感凝膠電泳)、TDGS (二維基因掃描技術(shù))和DHPLC (變性DNA 液相層析技術(shù))。

結(jié)果只有采用DHPLC法的實(shí)驗(yàn)室檢測出了先前用測序方法確定的所有的突變。

采用TDGS法的實(shí)驗(yàn)室只正確地鑒定了91%的突變。采用SSCP和CSGE法的實(shí)驗(yàn)室則分別正確鑒定了72%和76%的突變，它們的堿基替換鑒定率更低，分別為65%和60%。SSCP 和CSGE法有超過20%的突變根本就沒有鑒別出來。

Eng說，這種檢測的失誤，既有人為的原因，也由于方法本身存在缺陷的原因。這種檢測失誤造成人們以前對(duì)BRCA1的突變實(shí)際是低估了。

例如，以前的一項(xiàng)研究用SSCP法發(fā)現(xiàn)BRCA1的突變率為3.3%，現(xiàn)在看來實(shí)際突變率可能要接近5%。還有一項(xiàng)臨床遺傳風(fēng)險(xiǎn)研究用CSGE法對(duì)腫瘤患者的BRCA1進(jìn)行突變檢測，稱檢測到16%的突變，現(xiàn)在看實(shí)際突變率可能要接近27%。

臨床腫瘤學(xué)家要用這些流行病學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)向其患者提供咨詢意見并進(jìn)行治療管理，因此必須使這些數(shù)據(jù)盡量可靠。

這項(xiàng)研究對(duì)有腫瘤家族史的婦女有著更大的意義，以前用SSCP和CSGE方法對(duì) BRCA1和BRCA2 基因所作的遺傳學(xué)檢測有可能遺漏重要的突變，這會(huì)使他們放松對(duì)癌癥的警惕，以致不能早期發(fā)現(xiàn)與治療。

科學(xué)家也就除直接測序以外的其它方法的檢測費(fèi)用進(jìn)行了比較，結(jié)果檢測效果的DHPLC法，檢測費(fèi)用也zui高。他們認(rèn)為隨著技術(shù)的提高，各種方法的檢測效率會(huì)相應(yīng)的提高，檢測費(fèi)用則會(huì)越降越低。

這項(xiàng)研究還得到美國國立衛(wèi)生研究院(the National Institutes of Health ), 荷蘭癌癥協(xié)會(huì)(the Dutch Cancer Society )和 Ludwig-Boltzmann Institut fuer Experimenle Onkologie的資助。

本項(xiàng)研究的部分研究人員來自Myriad遺傳實(shí)驗(yàn)室，他們負(fù)責(zé)對(duì)樣品的BRCA1和BRCA2基因商業(yè)測序。