液相法可以解決直接包被于固相表面的抗原構(gòu)象可能發(fā)生改變的問(wèn)題。此外，這個(gè)方法也使以結(jié)合性親和力使基礎(chǔ)的選擇更加簡(jiǎn)單，因?yàn)檎故径鄠€(gè)抗體的噬菌體并無(wú)選擇優(yōu)勢(shì)。液相法也易于控制抗原的濃度，這也有利于選擇到有較高親和力的抗體。為了在液相中進(jìn)行噬菌體抗體選擇，可以使用任何免疫化學(xué)試劑公司銷售的試劑盒對(duì)抗原進(jìn)行*化。將抗體文庫(kù)與*化抗原孵育后，用鏈霉親和素或親和素磁珠能夠把抗原和其所結(jié)合的噬菌體，與未結(jié)合的噬菌體抗體分離開(kāi)來(lái)。經(jīng)適當(dāng)洗滌后，再用溶液酸或堿溶液洗脫噬菌體抗體。這個(gè)方法存在一個(gè)問(wèn)題，就是能識(shí)別鏈霉親和素的抗體也被分離出來(lái)。要避免這個(gè)問(wèn)題，可以在選擇前預(yù)先削減文庫(kù)中的鏈霉親和素結(jié)合抗體；在各輪選擇中，交替使用親和素與鏈霉親和素（這兩種生物結(jié)合蛋白結(jié)構(gòu)上差異甚大，不會(huì)發(fā)生交叉反應(yīng)。）；或者用二硫化N—羥基丁二酰亞胺*酯（NHS-SSbiotin）標(biāo)記抗原并用DTT進(jìn)行洗脫。