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德研究機構繪制miRNA表達譜

時間:2011-9-8閱讀:623
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         據報道,來自德國多個研究機構的研究人員繪制了來自病人血液的miRNA表達譜,其中包括自體免疫疾病、癌癥、心血管疾病以及慢性炎癥患者。

         miRNA是含有莖環結構的miRNA前體,經過Dicer加工之后的一類非編碼的小RNA分子(~21-23個核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白質復合物)在動物和植物中廣泛表達。因之具有破壞目標特異性基因的轉錄產物或者誘導翻譯抑制的功能,miRNA被認為在調控發育過程中有重要作用。

         miRNA不僅影響或者調控了細胞增殖、分化過程中的mRNA和關鍵蛋白質,還可能同時具有腫瘤抑制因子和原癌基因的功能,在癌癥的診斷和治療中發揮重要的作用。

        研究人員使用了高度特異的引物延伸型芯片,這種芯片表現出非常低的交叉雜交,可區分let-7家族的成員。平均說來,他們在每種疾病中找到103個下調的miRNA。與對照相比,總共62個miRNA在至少6種疾病中下調,而24個miRNA在一半以上疾病中下調。為了研究顯著下調的miRNA是否在物理位置上接近已知的易感變異體,他們提取了3495個發表的SNP,并在這些SNP周圍的250 kb范圍內搜索miRNA的編碼序列。他們檢測到241個SNP與miRNA接近的情況。

        結果顯示出,鑒定疾病與血細胞中miRNA表達譜變化之間的復雜關系,不僅有助于了解疾病關聯,還為病理過程提供了線索,因為miRNA影響了數千個基因的表達

 

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