根系圖像分析系統原理：
WinRHIZO根系分析系統利用高質量圖形掃描儀獲取高分辨率植物根系彩色圖像或黑白圖像，該掃描儀在掃描面板下方和上蓋中安裝有專門的雙光源照明系統，并且在掃面板上預留了雙光源校準區域。此外，還配備有不同尺寸的、高透明度根系放置盤。掃描時，掃面板下的光源和上蓋板中的光源同時掃過高透明度根盤中的根系樣品，這樣可以避免根系掃描時容易產生的陰影和不均勻等現象的影響，有效地保證了獲取的圖像質量。
WinRHIZO軟件可以讀取TIFF，JPEG標準格式的圖像。針對獲取的圖像，利用插入軟件密鑰解密的軟件，同時配合廠家針對掃描儀配置的Scanner.cal校準文件，對掃描獲得的高質量根系圖像進行分析。采用非統計學方法測量計算出交叉重疊部分根系長度、直徑、面積、體積、根尖等基本的形態學參數；利用軟件的色彩等級分析功能，還可以對根系顏色進行分析，從而進行根系存活數量、根系生長和營養狀況等方面研究；
根系圖像分析系統技術指標：
| 測量參數 | WinRHIZO版本 | ||
| 整體參數 | 基本版 | 標準版 | 專業版 |
| 總長 | Yes | Yes | Yes |
| 平均直徑 | Yes | Yes | Yes |
| 總面積 | Yes | Yes | Yes |
| 總體積 | Yes | Yes | Yes |
| 根尖、分叉和交疊計數 | Yes | Yes | Yes |
| 根直徑等級分布參數 | |||
| 長度 | No | Yes | Yes |
| 面積 | No | Yes | Yes |
| 體積 | No | Yes | Yes |
| 根尖計數 | No | Yes | Yes |
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