對于噴霧干燥來說，區分噴霧干燥機進口溫度、產品溫度、干燥溫度和干燥機出口溫度是相當重要的。在一個設計良好的同流式噴霧干燥機中,干燥溫度和干燥機出口溫度是相同的。由于產品中溶劑的蒸發,產品溫度會低于干燥器出口溫度,通常為5～20℃。

顆粒的干燥首先是由噴霧干燥機的出口溫度和噴霧干燥機排氣中的溶劑蒸汽含量來決定。較高的噴霧干燥機出口溫度或較低的噴霧干燥機排氣的溶劑蒸汽含量都將影響產品的干燥。對于一個固定的噴霧干燥機的出口溫度和干燥氣體流量來說,降低干燥機進口溫度將導致進料量的下降,蒸發量的下降,噴霧干燥機排氣的溶劑蒸汽含量的下降。所以，必須非常仔細地來平衡噴霧干燥機的參數,

噴霧干燥機可能會允許干燥在一個高獲得率的狀態下進行,但可能會同時導致zui終產品無法滿足殘留溶劑含量水平的要求。對于許多產品來說,有效干燥時間更加重要。當產品中殘留的溶劑擴散受到約束時,單級干燥機不能進行有效的干燥,在許多時候必須增加額外的干燥段。

有些藥物所表現出的熱塑性將導致其不適合在傳統的噴霧干燥機中進行干燥。這樣，低壓噴霧干燥可以是一種選擇。噴霧干燥機工作在0.5～0.7bar時,允許明顯降低干燥溫度。

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