醫院污水成分較為復雜，水質濃度不一，除消毐滅菌外還要進打不同程度的凈化處理。凈化處理的目的在于改善污水的物理、化學及生物學指標，以降低消毒過程中各種干擾物質的含量和改善水質指標，從而減輕水體的負擔，提高消毒效率。
　　洛陽醫院污水處理設備廠專家表示醫院污水的凈化處理，按順序分為一、二、三級處理。―級處理主要是用物理方法（如沉淀）除去污水中漂浮吟相感禪的污染雜質和寄生蟲卵等，對細菌的去除率不髙。二級處理是指甩生物化學方法余去―級處理后在污水中溶解的和晈狀的有機物質，使污水得到凈化,去除大部分病原菌。在—些排出點要求很高的情況下，還可增加三級處埋，即在機械處埋和生化處理之后，再采用物理化學方法將水賡進—步凈化，如用過濾、吸附和離子交換等方法。
　　我國多數醫院污水處理都經一、二級處理，具體處理設施和工藝流程，應根據醫院污水的性質、總污水量、污水排向等各種情況因地制宜的加以選擇。國內設計的生物濾池、生物轉盤、射流嗶氣接觸氧化物，塔式濾池等處理設施對微生物的請除率都還滿意。