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在發表于《細胞》(Cell)雜志上的新研究論文中,Schreiber和Broad研究所的同事對這一門戶進行了描述,指出其中包含的信息是通過測量240種癌細胞系對于超過350種靶向細胞回路不同節點的化合物的反應而獲得。這些細胞系來自許多不同種類的腫瘤,另一項稱作為癌細胞系百科全書(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)的互補研究已經確定了這些細胞系的基因組特征。在美國國家癌癥研究所癌癥靶點發現和開發(CTD2)項目的支持下,CTRP充分利用了CCLE的公共數據,其中包含了有關每個癌細胞系突變、基因表達和其他基因組改變的信息。
Schreiber和同事們證明,研究中的這組化合物可以用來發現癌細胞系從前未檢測到的依賴性。隨著正常細胞一步步地變為癌細胞,它會累積大量的促癌遺傳改變,使得細胞能夠不受控制地分裂和存活。此外,在癌癥形成的過程中,其他通常在細胞中發揮無害作用的基因有可能變得對癌癥生存至關重要。通過讓細胞系暴露于不同的化合物中,研究人員能夠揭示癌細胞生存所必需的蛋白質,并有可能提供新的治療靶點。
在他們的論文中,Schreiber和同事們描述了一個如何利用CTRP來發現候選依賴性的例子。研究小組發現一種在小細胞肺癌臨床試驗中測試的藥物navitoclax,或許能夠尤其有效地靶向帶有CTNNB1突變的癌細胞系。CTNNB1突變存在于一些大腸癌、肝細胞癌、胃癌和子宮內膜癌中。這只是一個關于CTRP如何能夠幫助揭示有用生物標記物的例子,利用生物標記物可以預測藥物反應和耐藥。除了發現已開發藥物的新用途,CTRP還可用于鑒別新的治療靶點。
Broad研究所團隊將繼續用新的數據填充CTRP,擴大這一資源,包括在更大量癌細胞系上解析化合物或化合物組合。
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