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DNA重組實驗方法

時間:2012-6-16閱讀:335
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實驗原理
DNA重組是將外源DNA與載體分子連接,這樣重新組合的DNA叫做重組體或重組子.DNA重組的方法主要有粘端連接法和平端連接法. 重組的DNA分子是在DNA連接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的連接緩沖系統中,將分別經酶切的載體分子與外源DNA分子進行連接.常用的DNA連接酶是T4噬菌體DNA連接酶,它不但能使粘性末端的DNA分子連在一起,而且能使平末端的雙鏈DNA分子連接起來,但這種連接的效率比粘性末端的連接效率低,一般可通過提高T4噬菌體DNA連接酶濃度或增加DNA濃度來提高平末端的連接效率.
如果是單酶切,為了防止載體本身的自身連接,可以用牛小腸堿性磷酸酶(CIP)處理,去掉酶切后5'端的磷酸.這樣做能有效防止質粒的自身環化,降低轉化的背景,大大提高重組子的篩出效率.
連接反應的溫度在37℃時有利于連接酶的活性,但是在這樣的溫度下,粘性末端的氫鍵結合是不穩定的.一般的連接條件是在12-16℃,反應12-16小時(過夜),這樣既可zui大限度地發揮連接酶的活性,又兼顧到粘性末端短暫配對結構的穩定.
連接產物轉化宿主細胞后,還須對轉化菌落進行篩選鑒定,挑選出所需的重組質粒.
儀器、材料與試劑
一、儀器
1.恒溫搖床
2.恒溫水浴
3.恒溫培養箱
4.小型高速離心機
二、材料
1. 氨芐*
2. BamHI
3. HindIII
4. T4 DNA連接酶
5. pQE-31 和pUC18-CAT 質粒
6. 培養皿
7. 接種針
8. 金屬涂棒
9. 1.5mL 離心管
10.酒精燈
11.鑷子、滅菌牙簽等
三、試劑
DNA瓊脂糖膠純化試劑盒
實驗步驟
一、質粒DNA
提取的pQE-31和pUC18-CAT 質粒.
二、制備重組DNA
1. 在滅菌的1.5mL 離心管中,加入pQE-31質粒10mL(2mg/mL),2mL酶切緩沖液,1mL BamHI 和HindIII酶 的混合液(各含10個單位),無菌雙蒸水7mL,至反應混合物總體積為20mL,離心混勻,37℃反應過夜.
2. 在另一無菌1.5mL 離心管中,加pUC18-CAT 質粒20mL,加入3mL酶切反應液,lmL BamHI和HindIII酶的混合液,無菌雙蒸水補到30mL,37℃反應過夜.
3. 反應完畢后取5mL pQE-31質粒的酶切液做電泳分析,檢驗酶切是否*.酶切*,進行下一步.
4. 將酶切處理的后pQE-31和pUC18-CAT 質粒,分別上樣跑瓊脂糖凝膠電泳(注意加DNA分子量標準).電泳結束后用DNA瓊脂糖膠純化試劑盒按照試劑盒說明書的方法回收DNA片段.前者回收的片段為3.5kb,后者為650bp.
5. 將回收的pQE-31載體質粒均分為兩份,其中一份與酶切后回收的CAT片段混合,做連接;另一份不加CAT片段,做對照.操作如下:
在10mL DNA樣品中,加T4 DNA連接酶緩沖液1mL,T4 DNA連接酶1mL,14℃(室溫)過夜,然后做大腸桿菌的轉化.
三、轉化感受態細胞
1. 制備的感受態細胞(-20℃保存的).
2. 在100mL的融化后處于冰浴的感受態細胞中,加入10mL連接產物,混勻,冰上放置30分鐘,以后的操作參照實驗一進行.同時做未加CAT片段的空白pQE-31載體質粒連接處理后的感受態細胞轉化的對照.
實驗結果
過夜培養后,實驗組和對照組的兩個培養皿上都可能會出現一些菌落.如果實驗組的菌落數明顯多于對照組的菌落,則是好征兆,但實驗組中出現的菌落是否含有所需的DNA重組子還須進一步鑒定.

 

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