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注意:當在組織培養板中進行不同劑量的siRNA轉染時,轉染試劑和siRNA轉染培養基的用量需要與不同孔的表面積成比率。
1,準備以下混合物:
(A)加1.8ul的10um siRNA到20ul 的siRNA轉染培養基中,輕柔混合,在室溫放置5分鐘 注意:如果需要低濃度的siRNA,用siRNA稀釋緩沖液稀釋
(B) 加1.2ul siRNA轉染試劑到20ul siRNA轉染培養基中,輕柔混合,室溫放置5分鐘。注意:雖然,對多種的細胞系有很高的轉染效率,但siRAN轉染試劑并不是對所有細胞都適合。
2,5分鐘后,混合A和B,形成siRNA-siRNA轉染試劑復合物,輕柔混合,室溫孵育20分鐘。
3,孵育后,加160ul siRNA轉染培養基到每個含有siRNA-siRNA轉染試劑復合物的管中,輕柔混合
從這一步起,對懸浮細胞和貼壁細胞的處理方法相同
4,轉染前,吸棄培養基,用0.3ml無菌siRNA轉染培養基洗細胞一次,去除培養基。
5,在洗過的細胞上,鋪稀釋的siRNA-siRNA轉染試劑混合物,37度,5-7小時
6,孵育后,向含有轉染細胞的每個孔中加200ul 生長培養基,其中的血清和抗生素濃度是正常濃度的兩倍,無需去除轉染混合物。如果,毒性是個問題的話,去除轉染混合物,以正常生長培養基代替。再孵育18-24小時
7,孵育結束后,用新鮮正常生長培養基替換,繼續孵育24-72小時
8,使用恰當的操作步驟檢測細胞,參見免疫熒光染色步驟
染色質免疫沉淀間隙連接蛋白45抗體說明書,CX45抗體價格
注意:CHIP的實驗步驟可以有很多不同版本,下面介紹的步驟適合大多數的實驗
常溫下,用PBS洗細胞,重懸細胞,使細胞數大約5*105個/ml(總細胞數2*107)。,
加甲醛,使終濃度為1%,室溫孵育10分鐘。
加*至終濃度
2000rpm,5分鐘,離心細胞。用冷的PBS洗細胞一次
用6ml的裂解緩沖液重懸細胞,輕柔混合,2000rpm離心5分鐘,收集粗提的核提取物。
再用PBS洗沉淀,沉淀可以凍存,或繼續以下步驟。
用1.9ml的高鹽裂解緩沖液重懸沉淀,轉移到2ml的離心管中準備超聲
超聲條件需要優化,下面介紹的條件是在使用Sonics VC130和
在冰上操作,輸出功率設置5(R)6,每隔30秒超聲一次,共4次。
4°C,10,000rpm 離心15分鐘,保存上清,確定上清中蛋白的濃度。
如果免疫沉淀,我們推薦100—500ug蛋白和0.1—1ul的TransCruz試劑(0.2—2ug)
注意:研究者可能希望使用連接有葡聚糖或磁珠的一抗,以便于選擇后續免疫沉淀的試劑。有些情況下,將針對同一種蛋白不同表位的抗體聯合使用會更好。
向染色質溶液加50ul Protein A/G-瓊脂糖,4度,孵育30分鐘,使其澄清,zui大速度,4度離心5分鐘。
向上清中加一抗,4度孵育過夜。
加50ul Protein A/G –瓊脂糖,4度孵育2小時。
12,000rpm離心20秒收獲磁珠,并將管放在冰上
用1ml裂解緩沖液洗磁珠2次
用沖洗緩沖液洗磁珠四次
重懸磁珠在400ul洗脫緩沖液中
通過在67度水浴中孵育管子2小時以上,使反向交叉連接
離心去除磁珠,繼續在67度水浴孵育上清過夜 Remove
10,000rpm離心3分鐘去除殘留的珠子,保留上清
分離DNA,用500ul 酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)抽提上清,劇烈振蕩,14,000rpm離心3分鐘分離兩相。
保留水相,用100ul
用600ul 氯仿/異戊醇抽提匯集的水相
DNA可以用商業化的試劑盒濃縮。
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