泡沫問題一般分為三種形式：
①啟動泡沫活性污泥工藝運行啟動初期，由于污水中含有一些表面活性物質，易引起表面泡沫。但隨著活性污泥的成熟，這些表面活性物質經微生物降解，泡沫現象會逐漸消失。
②反硝化泡沫如果污水廠進行硝化反應，則在沉淀池或曝氣不足的地方會發生反硝化作用，產生氮等氣泡而帶動部分污泥上浮，出現泡沫現象。
③生物泡沫由于絲狀微生物的異常生長，與氣泡、絮體顆粒混合而成的泡沫具有穩定、持續、較難控制的特點。生物泡沫對污水廠的正常運行是非常不利的：在曝氣池或二沉池中出現大量絲狀微生物，在水面上漂浮、積聚大量泡沫，造成出水有機物濃度和懸浮固體升高，產生惡臭或不良有害氣體，降低機械曝氣方式的氧轉移效率，可能造成后期污泥消化時產生大量表面泡沫。
解決辦法：
①噴灑水這是一種的物理方法。通過噴灑水流或水珠以打碎浮在水面上的氣泡，來減少泡沫。打散的污泥顆粒部分重新恢復沉降性能，但絲狀細菌仍然存在于混合液中，所以不能從根本上消除泡沫現象。
②投加消泡劑可采用具有強氧化性的殺菌劑，如氯、臭氧和過氧化物等。還有利用聚乙二醇、硅酮生產的市售藥劑，以及氯化鐵和銅材酸洗液的混合藥劑等。藥劑的作用僅僅能降低泡沫的增長，卻不能消除泡沫的形成。而廣泛應用的殺菌劑普遍存在副作用，因為過量或投加位置不當，會大量降低反應池中絮成菌的數量及生物總量。
③降低污泥齡一般采用降低曝氣池中污泥的停留時間，以抑制有較長生長期的放線菌的生長。
④回流厭氧消化池上清液已有試驗表明，采用厭氧消化池上清液回流到曝氣池的方法，能控制曝氣池表面的氣泡形成。
⑤投加特別微生物有研究提出，一部分特殊菌種可以消除 Nocardia菌的活力，其中包括原生動物腎形蟲等。另外，增加捕食性和拮抗性的微生物，對部分泡沫細菌有控制作用。
