選購游泳池用電解次氯酸鈉發生器時，除考慮設備的使用效果外，還應考慮設備運行后的成本投入，只有選購了運行成本低、合理的電解次氯酸鈉發生器，才是真正購買者利益的好設備。
電解式次氯酸鈉發生器使用的原材料主要是電、鹽和水，根據目前市場上鹽的，可以計算出電解式次氯酸鈉發生器的基本操作成本為：電解式鹽份4+電費2+水0.08=6.08元，因此，如果想生產50公斤的次氯酸鈉溶液，成本大約為6.08元。而且根據行業的不同實際使用效果也會有所不同，如對游泳池的水質進行消毒，使用電解次氯酸鈉發生器，其使用成本如下：
按照我有關游泳池水質的規定，若要達到家規定的余氯含量，必須將游泳池水中的余氯含量提高到0.3-1.0PPM，按每噸水投加有效氯4-5克計算，1公斤次氯酸鈉溶液可消毒1000/4.5=222噸水。
因此，按照上述公式，如果是一座擁有2000噸水的游泳池，則需要使用生產的1000克/時的電解法次氯酸鈉發生器，而該設備如果是一年365天全天候運行的話，運行成本要比其它消毒水設備運行成本高一些，但安全性要高很多。

因此，雖然使用游泳池用電解次氯酸鈉發生器的成本比使用二氧化氯發生器的成本稍高一點，但由于在實際使用過程中，用戶只需投加定量的鹽和水，就能滿足設備的運轉，不會產生對人體有害的危險化學品，且無需購買其他危險的化學藥品，所以說，實際上，綜合起來，使用電解法次氯酸鈉發生器的運行成本并不高，而且使用方便，一次投加就能滿足很長時間的使用，非常游泳池等場所的要求。