根據廢水中所含主要污染物性質, 可以分為實驗室有機和無機廢水兩大類。無機廢水主要含有重金屬以及其他無機離子等。有機廢水含有常用的有機溶劑、有機酸等物質。相比而言, 有機廢水比無機廢水污染的范圍更廣, 帶來的危害更嚴重。不同的廢水, 污染物組成不同，處理方法和程度也不相同。實驗室污水的處理本著分類收集， 就地、及時地原位處理， 簡易操作， 以廢治廢和降低成本的原則。
實驗室有機污水處理設備：實驗室有機廢水處理方法可以借鑒其它有機廢水的處理。一般來說有機廢水處理技術主要包括生物法和物化法。對有機物濃度高、毒性強、水質水量不穩定的實驗室廢水， 生物法處理效果不佳， 而物化法對此類廢水的處理表現出明顯的優勢。實驗、對實驗室廢棄物進行分類處理及回收循環再利用， 不僅能減小對環境的污染， 而且能減少化學藥品的浪費。對高濃度實驗室有機廢水， 將其中的有機溶劑如醇類、酯類等回收循環使用后， 再用化學方法處理； 對濃度高、毒性大且無法回收的有機廢水， 需要進行集中焚燒處理。
選用無機絮凝劑和有機陰離子配制成水溶液加入廢水中，便會產生壓縮雙電層，使廢水中的懸浮微粒失去性，膠粒物相互凝聚使微粒增大，形成絮凝體、礬花。絮凝體長大到一定體積后即在重力作用下脫離水相沉淀，從而去除廢水中的大量懸浮物，從而達到水處理的效果。為分離效果，可適時、適量加入助凝劑。
實驗室有機污水處理設備：在國內，有很多排污單位因為沒有找到適合自身的廢水處理方案，花費了巨大的投入，實驗室廢水處理后卻不能達標；或是廢水處理設施建成后運行費用過高，導致造價昂貴的實驗室污水處理設備成為了擺設，這些都是非常普遍的現象。
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