醫院污水處理流程如下：
　　一、一級處理流程
　　醫院門診污水處理設備 的一級處理通常包括化糞池、沉淀池、雙層沉淀池或是調節池等處理沒施。在一些簡易醫院污水處理中，有的不設置沉淀池和調節池，而是利用化糞池作為一級處理設施。化糞池出水經過格柵、定量池(或集水井)直接進入氯化接觸池。
　　二、二級處理流程
　　當醫院污水一級處理出水不能滿足排放標準水質要求時，通常采用二級處理流程，即生物處理去除醫院污水中的有機污染物，如BOD5、COD、酚、LAS等。二級處理出水水質改善，還可以減少消毒劑用量，提消毒效果。醫院醫水采用的二級處理方法有生物接觸氧化法、生物轉盤法、塔式生物濾池法、射流曝氣法和氧化溝法等。
　　三、醫院污水處理總流程
　　醫院污水處理系統除了包括含菌污水的處理和消毒外，對其他各種特除排水根據需要還應單獨處理，如含有重金屬的廢水，放射性廢水、含油廢水和洗印廢水等。重金屬廢水來自牙科治療和化驗室，含有汞，鉻等有害污染物，可用化學沉淀法或離子交換法處理。放射性廢水來自同位素治療和診斷。濃度放射性廢水采用衰變池處理，或用化學共沉淀法、離子交換法處理。含油廢水來自廚房食堂，一般采用隔油池處理。洗印廢水來自照片洗印，含有銀、顯影劑、定影劑等有害物質、含銀廢水可采用電解法回收銀，顯影劑可用化學氧化法處理。