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醫藥化工廢水廠中微生物群落結構分析

2020-5-21 閱讀(280)

醫藥化工廢水廠中微生物群落結構分析:

抗生素的濫用誘導和加速了抗生素性基因(antibiotic resistance genes, ARGs)的產生、傳播以及抗生素耐藥菌(antibiotic resistant bacteria, ARB)形成的風險, 并且ARGs的存在是細菌表現耐藥性的根本原因.ARGs作為一類新型的環境污染物, 可通過質粒、整合子以及轉座子等可在細菌同種屬菌株間和不同種屬的菌株之間發生水平基因轉移, 即使ARB死亡后, 攜帶ARGs的裸露DNA會在脫氧核苷酸酶的保護作用下長期存在, 故ARGs在環境中的持久性殘留、傳播和擴散比抗生素本身的危害還要大.目前, ARGs廣泛存在于不同的生態環境中, 如水環境、土壤和大氣, 其中作為水環境之一的污水廠被認為是ARB和ARGs巨大的儲存地.以前針對ARGs的大多數研究主要集中在處理醫院和生活污水的城市污水廠上.然而, 迄今為止, 很少有報道從醫藥化工廢水中檢測出ARB和ARGs。

ARGs的檢測方法有可培方法和非培方法這兩大類.可培方法是通過培養基進行微生物分離, 而后根據所分離微生物的耐藥性, 結合各種分子生物學方法或者對ARB進行全基因組.但是由于自然環境中超過99%的微生物不能用傳統培養基方法進行分離培養, 故可培方法會遺漏大量ARB和ARGs.非培方法有PCR技術、qPCR技術、基因芯片技術及宏基因組學技術.無論是普通PCR技術還是qPCR技術只能局限于已知序列的單一耐藥基因檢測, 并且只能對少數的ARGs進行同時檢測, *后還需要測序分析來進一步確認.基因芯片技術雖然可以同時檢測出大量的ARGs, 但仍然要依賴于根據已知的耐藥基因序列設計出相應的特異性強的探針, 并且其制作復雜, 費用昂貴.而隨著生物技術的不斷發展, 宏基因組測序也越來越多地應用于醫學研究及臨床診斷領域, 如感染類型診斷、抗性基因的鑒定和傳染病的防控等.宏基因組技術通過高通量測序, 打破了傳統以培養為主的微生物研究方式, 直接提取遺傳物質進行遺傳操作, 不僅可以準確獲得樣品微生物物種組成及豐度等信息, 進入數據庫預測微生物功能, 還能分析微生物代謝網絡等多方面的信息, 并且可同時檢測大量的ARGs, 為尋找新基因、研究微生物多樣性提供了便利的工具。

 



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