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上海鈺博生物科技有限公司
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閱讀：145發布時間：2017-3-3
白血病是發達國家癌癥死亡的主要原因。國內外一直努力尋找用于白血病診斷的分子生物標志物，但由于白血病的異質性和復雜性，它的發生發展涉及多個分子組分之間的相互作用。因此，目前普遍使用的單個分子標志物具有一定的局限性。網絡生物標志物被認為在疾病表征中優于個體分子。
日前來自蘇州大學系統生物學研究中心的學者發表論文于Journal of Cancer，名為基于基因表達和蛋白之間相互作用的數據，構建網絡生物標志物可準確預測白血病。
該研究整合蛋白質相互作用網絡和基因表達數據，在系統層面上對白血病的關鍵基因進行模塊化分析，構建可以為診斷白血病提供依據的網絡生物標志物。首先，我們選擇蛋白質相互作用網絡數據庫 PINA 和數據庫 GeneGo中白血病相關基因，重建白血病特異性蛋白質相互作用網絡。接下來，進一步整合基因表達數據 以識別具有白血病相關性的活性模塊。zui后，評估候選網絡生物標志物的診斷性能。zui終得到一個包含97個基因和400條映射關系的網絡用于準確診斷白血病。功能富集分析結果顯示，該網絡標志物中的基因主要富集在白血病等癌癥相關通路上。
網絡生物標志物相比于單個標志物可以更加有效的區分白血病的疾病樣本和正常樣本。網絡生物標志物提供了診斷白血病的有效方法，也有助于進一步了解白血病的分子基礎。
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