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上海永葉生物科技有限公司

DNA的隨機片段化

時間:2011-10-13閱讀:817
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[器材和試劑]
●  Tag DNA聚合酶(Boehringer、Promega或者Stratagelle)  
●  10×Tdg緩沖液  (BOehringer、  Promega或者Stratagene)  
●  dATP、  dGTP、  dCTP  各  2mm01/L       (AmershamDiOSCiences)   
●  dTTP-dUTP混合物:2mmol/L-0mm01/L,  1.5mmol/L-0.5mm01/L,  1mmol/L1mmol/L,  0.5mmol/L1.5mm01/L,0mm01/L2mmol/L(Amersham Biosciences)
● 上游和下游引物(各25pm01)
●  模板DNA樣品(各1~50ng)
●  QIAquick離心柱(Qiagen)或者QIAEXⅡ膠抽提試劑盒(Qiagen)
●  來自大腸桿菌的內切酶V(Trevigen)
●  10X內切酶V緩沖液(Trevigen)
 
[方法]
A.含有*的重組模板的制備
1.混合5/ll 10XTaq緩沖液,均為0.2mmol/L的dATP、dGTP和dCTP以及0.2mmol/L dTTP-dUTP混合物,  l~50ng模板DNA,  上下游引物各25pm01和1.25U Tdq DNA聚合酶。總體積為50ul。
2.95℃加熱PCR混合物1分鐘,接下來進行25~30次如下循環:94℃孵育30秒,55℃孵育30秒,然后72℃30秒。zui后72℃孵育7分鐘。
3.通過含有溴化乙錠(0.5Hg~1)的1%(w/v)瓊脂糖凝膠電泳分離DNA片段。在紫外燈下觀察DNA并切下位于預定大小區域的DNA。
4.純化片段(例如使用QIAspin柱或QIAEXⅡ試劑盒)并用27ftl超純水洗脫。
 
B.重組模板的內切酶V消化
1.加3ul 10X內切酶緩沖液和1U內切酶V。
2.溶液在37℃孵育12小時,接著95℃加熱10分鐘。
3.通過含有溴化乙錠(0.5/ug~1)的2%(w/v)瓊脂糖凝膠電泳分離DNA片段。在紫外燈下觀察DNA并切下位于預定大小區域的DNA。
4.純化片段(例如使用QIAspin柱或QIAEXⅡ試劑盒)并且用30ul超純水洗脫。使用3~10ul純化的片段來繼續進行合成反應

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