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上海滬宇生物科技有限公司

外顯子組測序發現心臟病保護因子

時間:2014-8-12閱讀:334
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對復雜疾病的外顯子組測序研究,受到諸多因素的挑戰,包括等位基因異質性、疾病風險相關變異的較大數量和適度效應量、中性變異的大量存在(甚至在表型相關基因中)。具有zui近瓶頸的孤立群體,為研究復雜疾病的罕見變異,提供了很多優勢,因為他們有害變異出現的頻率更高,罕見中性變異大幅減少。

遺傳學家們都知道,由于一種稱為“瓶頸”的現象,孟德爾隱性遺傳疾病(如Tay-Sachs或囊胞性纖維癥,都是由一個單一的基因突變引起)更常見于孤立人群。當一個小群體被孤立了幾十到幾百個世代之后,人口的遺傳多樣性就受到限制,偶然罕見的基因變異可能意外地變得更加常見。雖然*以來科學家*,這是孤立人群中*罕見疾病模式的來源,但這篇論文表明,相同的原理可能幫助研究人員,在這些孤立群體中識別全基因組關聯研究中罕見的功能缺失變異。

LPA基因編碼脂蛋白Lipoprotein(a)——一種脂蛋白類型,在1963年發現,是一個已知的心臟疾病危險因素。在這篇論文中所描述的變異,可減少LPA基因表達的水平,引起血液中較低水平的Lipoprotein(a)。該研究小組研究了芬蘭的醫療記錄,發現功能缺失變異與其他健康問題并不相關,這使得阻斷LPA表達成為一種潛在的治療方法。集中芬蘭醫療記錄的有效性,使研究人員能夠把醫學遺傳學范式轉向“genotype first”的方法。

這一新方法可明顯改變研究人員如何分析復雜疾病的罕見變異。它為我們研究以前沒有研究過的復雜疾病遺傳學,提供了一個窗口。通過結合詳細的醫療記錄信息和瓶頸群體基因組中所包含的信息,我們正在揭開導致復雜疾病的罕見變異。

心臟病是范圍內的一個主要殺手。世界衛生組織報道稱,心血管疾病引起所有死亡人數的30%。通過靶定LPA特異性解決這種風險的治療方法,可能對醫療結果有一個性的影響。

這項工作凸顯了利用孤立人群中罕見變異分析來研究復雜疾病的潛力,這種方法以前主要限于孟德爾性狀。現在,該方法可以被應用到其他有許多遺傳因素參與的復雜疾病。

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