從自然效率來看，生物質原料在美國和各地產量豐富，它含大量氧（約占40％以上）。為了zui有效地利用這種生物量，必須使整個原料轉化，包括氧。纖維素乙醇是替代的運輸燃料，它保留了原料中絕大部分的氧。

基于光合成的基礎知識和熱力學簡單法則，生物質原料現成可用，并高含氧，它屬于木質纖維材料。對于從這種原料生產液體燃料或化工原料，制勝戰略是生產的產品要能zui高產率地使用整個原料，業已證明zui有效和有廣泛用途的是生產乙醇。

乙醇與生物質中氧的配伍性和對碳較低的需求，從而使與替代方案，如生產丁醇或烴類相比，生產乙醇可以有較高的產率和較高的產熱量（BTU/供入的每t生物質）。乙醇的理論產率為51％，正丁醇和異丁醇的理論產率為41％，C 8辛烷烴類的理論產率為29.7％。

上海科興纖維素乙醇轉化途徑：大部分的研發都集中在生物化學途徑或熱化學途徑，均可從生物質生產乙醇。生物化學途徑使用酶，使經預處理的木質纖維素生物質原料轉化成糖類，糖類然后再發酵成乙醇。熱化學途徑系將生物質原料氣化以制取合成氣，合成氣然后利用化學催化的化學反應被轉化成乙醇。但是生物化學途徑受限于昂貴的預處理需求；不能使木質素發酵（生物質含有20%~25％木質素）；纖維素轉化為葡萄糖具有生物學復雜性；原料靈活性受限制。

熱化學途徑受限于催化劑的選擇性；通過組合放熱反應會造成熱力學低效率，并且需采用特定的H2 :CO比例；需采用高壓（> 1000磅/平方英寸），增大了設備的復雜性和資本費用；對雜質具有敏感性。

至此，一種新途徑也已脫颕而出：由氣化、合成氣發酵和分離組成，因為它有原料靈活性而具吸引力；它能夠使用所有的原料；它產生溫室氣體少；能選擇性地生產乙醇；操作費用低；投資費用低。

排放和發動機的效率：許多研究和報告業已表明，使用乙醇，可減少有害排放，如一氧化碳、揮發性有機化合物（VOC）和硫氧化物。乙醇的高辛烷值使之可使用較高的壓縮比，尤其是專門使用乙醇的汽車。高的蒸發熱產生進料的冷卻效果，特別是在直噴式發動機中，這又可允許使用更高的壓縮比。這種效應因燃料數量增多而可提升，釆用較多的燃料數量可補償乙醇較低的能量含量。