系統生物學的發展歷史
實驗方法與系統方法構成科學研究的基本方法，19世紀是實驗生物學（生態、生理、遺傳與醫學等）范式建立，20世紀是實驗生物學迅速發展和系統生物學（生態、生理、遺傳與醫學等）范式形成。系統科學（包括控制論、信息論）根源于生命科學，發展了計算機科學而又應用于生物科學，將開發出生物計算機。維納與香農從動物與通訊行為的研究中提出控制論與信息論，整個系統科學根植于有機體哲學思維。系統生物學，zui初開創于貝塔郎菲的一般系統理論與理論生物學，艾根的超循環理論發展了細胞、生物化學與分子層次的系統論。20世紀70年代召開了“系統論與生物學” （systems theory and biology） 會議，80年代召開了生物化學系統論、生物系統的計算機模型等探討的會議 （第11屆分子系統生物學會議2009 年6 月于中科院上海召開）。系統生物學的概念在20世紀中葉已經提出，合成生物學的概念提出于基因重組技術的產生，進化理論、有機分子合成可以說是zui早的探索。
系統生物學的發展經歷了三個歷史時期：*期，生態系統，系統生態學與行為、心理學，開始于 20 世紀60~70 年代；第二期，生理系統，系統生理學與神經、內分泌、免疫學，開始于20世紀70~80年代；第三期，遺傳系統，系統遺傳學與胚胎、發育生物學，系統遺傳學的概念與詞匯于20 世紀90 年代中科院曾邦哲（曾杰）發表，并于1996年主辦第1 屆轉基因動物學術研討會（秘書長）闡述了系統論與生物工程、輸卵管生物反應器及基因組進化與生物體發育自組織系統理論，遺傳學從染色體行為的細胞遺傳學、基因表達信息流的分子遺傳學，發展到了系統遺傳學的細胞發生信號傳導與基因調控網絡研究，并重新于第19屆遺傳學大會闡述（包括指出C. Nuslein-Volhard、S. Brenner[7]等是較早以systematic方法研究遺傳學的科學家）。2008 年3 月美國加州舉辦了整合與系統遺傳學會議，2009 年10月荷蘭召開了系統遺傳學研討會。 1999 年初于德國建立系統生物科學與工程網及籌備聯合協會、會議等 （1999 年10 月Nature 和12 月Kybernetes），曾邦哲（ZengBJ）定義生物系統理論與實驗、計算 （computational）、工程方法的生物系統分析與人工生物系統研究，并闡述其自組織系統結構理論基礎，1999-2000年將籌備通知發送到系統科學、計算機科學、納米科學、生物醫學、生物工程等廣泛領域的科學家（包括邀請C. Nuslein-Volhard、Tomita等科學家），細胞是由大規模生物分子（納米）構成的復雜生物系統，基因組是可以重編程序的智能系統，生命系統人工設計與改造，可以開發出細胞生物機器。 2000 年同期，日本Kitnano 和Tomita 舉辦系統生物學會議，美國Hood 建立系統生物學研究所，美國 Kool 重新提出合成生物學的概念。2001年WolkenhauerO.6月（9月出版）、Ideker T & Hood L9月和Kitano H.10月（MIT出版2000年會議論文集）等發表文章論述系統生物學的系統論、組學和計算方法等，2002年日本北野宏明（Kitano H.）[8]、2003年美國胡德（Hood L.）[9]也論述了系統生物學是實驗與計算方法整合的生物系統研究，2008年Nature文章[10]則論述了系統生物學與合成生物學的結構理論。2005年Ideker贊同是如同Kitnano的分子水平的系統生物學概念，2007年Kinano闡釋系統生物學是在分子生物學層次的重新提出。計算生物技術、組學 （omics） 生物技術與合成生物技術，構成系統生物學發展的技術基礎 - 系統生物技術 （systems biotechnology），現代系統生物學是生物系統的理論與技術整合的研究體系。21 世紀伊始，刊物 Nature、Science 發表系統生物學、合成生物學等專刊，終于進入了系統生物科學（簡稱系統生物學）化迅速發展時代。
