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北京綠源伯德生物科技有限公司
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閱讀:329發布時間:2015-7-31
垂體前葉是調控動物產后生長zui重要的內分泌器官,主要是通過控制生長激素(GH)基因轉錄,合成以及分泌。作為動物產后生長研究的理想模型,巴馬小型豬相較于大型豬具有較低的生長性能和較少的個體差異。
在本項研究中,華南農業大學張永亮教授的課題組采用miRNA芯片和mrna-seq對巴馬小型豬和長白豬垂體前葉的miRNA和mRNA表達譜進行了關聯分析。共檢出222個miRNAs和12,909個轉錄本,這些miRNAs和mRNAs在兩個品種中表現出較高的相關性(r>0.97)。實驗鑒定到41個差異表達的miRNA和2,254個差異表達的轉錄本。通路分析表明,在兩個品種中共有32個通路存在顯著差異。值得注意的是,兩個GH調節信號通路——cAMP和三磷酸肌醇(IP3),以及多個GH分泌相關的轉錄本在巴馬小型豬中顯著下調。進一步地,研究人員使用TargetScan和RNAhybrid預測了差異表達miRNAs(DE miRNAs)和差異表達基因(DE mRNAs)的相互作用。有趣的是,通過分析它們的變化倍數,發現大多數DE miRNA–DE mRNA靶基因對(63.68–71.33%)呈現負相關的表達模式。研究人員提出了一個可能的miRNAs,基因,和GH調控通路之間的網絡。在這個網絡中,研究人員采用雙熒光素酶報告基因實驗驗證了兩個miRNA-mRNA的相互作用(Y-47靶向FSHB;ssc-miR-133a-3p靶向GNAI3)。 此項研究將有助于更好地理解動物產后生長的潛在分子機制。
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