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研究對于lncRNAs在重編程中的作用提供了*見解,并在p53和異染色質之間建立了一種新的。
誘導多能干細胞(iPSCs)對于再生醫學、體外疾病模型和毒理學篩選有重要影響。然而,要達到這些預期,我們有必要了解重編程機制如何消除和重寫體細胞表觀遺傳學編碼。這很重要,因為重編程很容易出錯,這可能會阻礙衍生細胞的生物醫學應用。
現在,通過外生因素的重編程,被認為是一個多步驟的過程,在此過程中細胞必須克服一系列的障礙,zui終才能獲得多能性,但是在某種情況下它可能也是確定性的。兩個基本的重編程障礙是:p53介導的反應,可促進細胞凋亡和細胞衰老;先存的體細胞樣表觀遺傳標記的去除效率低下。因此,p53或H3K9甲基轉移酶Setdb1、Suv39h1和Suv39h2的損耗,以及DNA甲基轉移酶DNMT1的抑制,可提高重編程的效率。
非編碼RNA在不同重編程障礙的構建或刪除過程中,發揮著重要的作用。然而,盡管micrornA (miRNA)網絡在重編程中的廣泛表征,目前已知只有2個長非編碼RNAs (lncRNAs)可調節這一過程。LncRNAs是不超過200個核苷酸的非編碼RNA種類,充當誘餌、指南或支架的作用。LincRNA-RoR是*個與重編程有關的lncRNA。相反,lincRNA TUNA與Nanog、Sox2和Fgf4啟動子區的幾個RNA結合蛋白,形成了一種復合物,在那里它有利于活性組蛋白標記H3K4me3的沉積。
在這項研究中,通過表達譜和功能篩選,研究人員確定,大的基因間非編碼rna p21(lincRNA-p21)可損害重編程。值得注意的是,lincRNA-p21是由p53誘導,但是并不促進重編程中的細胞凋亡或細胞衰老。相反,lincRNA-p21與H3K9甲基轉移酶SETDB1和DNA甲基轉移酶DNMT1有關,這是由RNA結合蛋白HNRNPK促進的。因此,lincRNA-p21可通過維持多能性基因啟動子的H3K9me3和/或CpG甲基化,阻止重編程。
在這篇論文成稿過程中,Dimitrova等人利用一種基因刪除方法證明,lincRNA-p21也順式作用以誘導p21表達并減少MEF增殖。與我們的研究工作相反,敲除掉MEFs的lincRNA-p21 之后,Huarte等人并沒有檢測p21表達的任何減少。Dimitrova等人還推測,lincRNA-p21可通過增加p21,阻斷MEFs的OSKM重編程,但是他們并沒有在此設置中量化細胞增殖。這種差異的一個可能解釋是,lincRNA-p21的*抑制,是解除p21所必需的。還需要進一步的實驗來澄清這一問題,有可能lincRNA-p21是通過多種機制來調節重編程的。
總之,這項研究可以指導其他研究人員調查lncRNA在重編程中的作用,也指出了p53、HNRNPK和lincRNA-p21調節基因表達的一種新機制。未來的研究工作將進一步探討,重編程過程中lincRNA所控制的網絡,這將與迄今為止所確定的障礙形成新的。
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