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細胞分化就是由一種相同的細胞類型經過細胞分裂后逐漸在形態、結構和功能上形成穩定性差異，產生不同的細胞類群的過程。 也可以說，細胞分化是同一來源的細胞逐漸發生各自*的形態結構、生理功能和生化特征的過程。其結果是在空間上細胞之間出現差異，在時間上同一細胞和它以前的狀態有所不同。細胞分化是從化學分化到形態、功能分化的過程。分裂不等于分化。
從分子水平看，細胞分化意味著各種細胞內合成了不同的專一蛋白質（如水晶體細胞合成晶體蛋白，紅胞合成血紅蛋白，肌細胞合成肌動蛋白和肌球蛋白等），而專一蛋白質的合成是通過細胞內一定基因在一定的時期的選擇性表達實現的。因此，基因調控是細胞分化的核心問題。
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