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中國水產(chǎn)科學研究院黑龍江水產(chǎn)研究所8日對外發(fā)布,由該院孫效文研究員的合作研究團隊,完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪制,并揭示其*的全基因組復制事件,這是上*完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果近日發(fā)表于《自然-遺傳》(Nature Genetics)雜志。
鯉魚是分布和養(yǎng)殖范圍zui廣泛的經(jīng)濟魚類之一,是中國具有代表性的淡水養(yǎng)殖魚類,是zui有條件利用基因組資源進行品種改良的水產(chǎn)養(yǎng)殖物種。鯉魚基因組由100條染色體組成,是迄今完成全基因組測序的脊椎動物中染色體數(shù)目zui多的物種。
該研究團隊完成了雌核發(fā)育鯉魚的基因組深度測序、精細圖譜繪制和基因組注釋,其基因組由16.9億堿基組成,含有52610個功能基因,約為多數(shù)硬骨魚類基因數(shù)目的兩倍。研究團隊從基因組尺度證實了鯉魚基因組的異源四倍體特征及其*的全基因組復制事件,分子鐘證據(jù)表明鯉魚基因組四倍化大約發(fā)生在820萬年前,是迄今在脊椎動物中發(fā)現(xiàn)的zui近的全基因組倍增事件。研究團隊還開展了10個代表性品系(種群)33尾鯉魚的基因組重測序研究,繪制了鯉魚的單堿基分辨率基因組遺傳變異圖譜。此外,通過全基因組多態(tài)性掃描和比較轉(zhuǎn)錄組分析等手段,識別和定位了鯉魚鱗被缺失、體色決定等性狀相關(guān)的遺傳位點、功能基因和調(diào)控通路。
鯉魚全基因組序列圖譜的完成,標志著鯉科魚類重要經(jīng)濟性狀的遺傳解析和遺傳選育研究全面進入基因組時代。對于解析鯉科魚類生長、品質(zhì)、抗病、抗逆等重要經(jīng)濟性狀的分子機制具有重要意義,同時也為研究脊椎動物基因組進化和基因衍化機制提供了寶貴的數(shù)據(jù)和模型,為開展全基因組選擇育種,培育品質(zhì)優(yōu)良的鯉魚新品種奠定了堅實基礎(chǔ),具有重要的理論意義和應(yīng)用價值。
來源:中新社
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