有色金屬礦山的廢水主要來自于采礦礦井水和選礦廢水，其中選礦廢水約占礦山總廢水的百分八十五左右。在有色金屬礦浮選過程中，為了能夠有效地分離出有用礦物，需要加入大量的浮選藥劑，如捕收劑、起泡劑、調整劑等，這些浮選藥劑及其分解產物以及礦物中溶蝕的金屬離子、礦物微細顆粒形成的懸浮體等都將殘存在選礦廢水中，使選礦廢水含有大量有害物質。
有色金屬礦山廢水處理中廢水的危害有以下幾個方面：
（1）大部分有色金屬礦石中都含有硫化物。這些硫化礦物通過氧化、風化、分解及水-氣-酸-礦物反應的綜合作用，會導致形成有色金屬礦山所*的酸性廢水，而且該廢水的危害程度與廢水的產量、pH值、所含金屬離種類及價態等有關。
（2）有色金屬礦山廢水中的主要污染物包括有毒有害物質(金屬離子及各種有機和無機藥劑)及強酸強堿和油類物質，它們都會污染地表水、地下水。
（3）酸堿和油類物質有色金屬礦山廢水普遍是酸(堿)性廢水。酸堿廢水排入水體后，使水體pH值發生變化，抑制細菌和微生物的生長，破壞水體自凈能力，破壞生態的正常循環，還會腐蝕船舶和水工建筑物。油類物質也是有色金屬礦山廢水中較為常見的污染物。含油廢水浸入土壤孔隙內，會形成油膜，產生堵塞作用，破壞土壤結構，不利于植物的生長，甚至使農作物枯死；水面存在的油膜會導致水生生物因缺氧而死亡。
